Diburu dan kehabisan solusi, Phil Coulson menempatkan timnya tepat di garis tembak dengan harapan dapat menyelamatkan mereka semua. Namun, dengan adanya Jenderal Glenn Talbot, HYDRA, dan Carl Creel yang ikut menyerang, mungkinkah mereka bisa bertahan hidup? Sementara itu, seorang Dokter misterius menyimpan beberapa rahasia berbahaya yang dapat menghancurkan salah satu anggota tim inti.
